Еще раз говорю. Расширение файла никак не влияет на содержимое файла. Это нужно, как ты сам сказал, для того, чтобы можно было "увидеть" скрипт (а точнее просто различить). Взгляни на скриншоты, надеюсь понял, про что мы
Раксамп ищем по +- такому шаблону:
путь до папки scripts//любое название файла.lua
Мунлоадер же ищет и .luac файлы.
От изменения расширения ты меняешь только путь до твоего файла. Закодируй скрипт, потом просто переименуй его в .lua файл и раксамп его заметит